黄宗羲虽然是从徽州出发了，但现在清军己经兵临城下，当然不会等着黄宗羲去把商家军请来，因此仅仅只过了两天，就杀到了徽州城外不足十里的地方。
而在徵州城里，方国安和方元科叔侄两人也率兵出城，迎战淸军。虽然明军的数量不少，但都是胡乱拼凑起来的乌合之众，那里是清军的对手，双方交战了不到一个时辰，就被清军打得大败而回。而清军趁势就杀到徽州城下，开始攻城。
这一下徽州城里顿时一片恐慌，而东林党和地方势力也终于消停下来，不再内斗了。并且开始心平气合的商量，徽州是肯定守不住了，那么现在应该向那个方向逃跑呢？
但还沒等他们商议出一个结论来，陈洪范就开城投降，把清军放入徽州城中。
原来在出使北方时，陈洪范就己经向清廷投降，回到南京是为清廷作内应的，并且劝降其他的明朝官员。不过当时出使北方的官员中，只有他一个人回到南京，也引起了不少人怀疑，但因为缺少证据，只好将他摆官了事。而陈洪范也就此蛰伏起来，等待时机。
清军进攻南京时，陈洪范估计有商家军在南京驻守，自己是找不到机会，因此也不敢轻举妄动，只好跟着大潮退出了南京，后来在南京失守以后，他听说潞王在徽州监国，立刻就投奔过来，准备在这里找点功劳，再投奔到清廷去。而就在淸军攻城的时候，陈洪范借自己指挥守城之机，说服了士兵跟随自己一起向清军投降，然后打开城门，放淸军入城。
徽州城破，无论是东林党还是地方势力，立刻都作鸟兽散、黄镇周、袁宏勋、张秉贞、朱大典等人保护着朱常淓想逃出徽州，但清军有陈洪范领路，道路熟悉，很快就追了朱常淓一行。结果一场混战之后，黄镇周、袁宏勋等人都死在乱军之中，张秉贞、朱大典侥幸逃走，而朱常淓也在混乱中被陈洪范亲自抓住，尽管朱常淓苦苦哀求陈洪范放自己一条生路，但陈洪范根本就不为所动，将朱常淓献给清军，做为自己的投效之功。只有方国安和方元科叔侄两人带领着千余残兵，杀出徽州，落荒败亡。
潞王监国仅仅只成立了不到一个月的时间，也就这样被清军灭亡，而奉命去向商毅求救的黄宗羲，直到徽州城破的三天之后，才赶到杭州，这个时侯自然也什么都晚了。
听明石姬说完了徽州城破的整个经过之后，商毅也不禁摇头苦笑，他到是不在乎潞王监国灭亡，不过徽州失守，也使浙江的西南面也就出现了空隙，需要派兵驻守。因此商毅也夸赞了明石姬几句，对她能够极时发回消息表示了赞扬。
等明石姬离开之后，商毅忽然想到，这也说不定是一个战机，因为如果能够击败这一路清军，重新夺回徽州，不仅可以保护浙江的西南安全，而且还可以在南京的南面打开一个缺口，就可以调动清军，或许就能够找到更多的战机，扭转目前的局面。那么应该怎样调派兵力，到是要好好思考一下。
一边想着，商毅也回到了自己的内宅，正好这时叶星士在给叶瑶瑱做每天例行的诊脉查看胎像。因为在怀孕最初的三个月，也是胎像最不稳定的一段时间，现在叶瑶瑱己经有了两个月的身孕，虽然不过从外表还看不出什么来。但却倍受商毅的重视，好在是总体来说胎像都还十分稳定。
虽然在进屋之后，商毅尽量做出一付轻松的样子来，但叶星士和叶瑶瑱都是什么人，一看就看出商毅心里有事，而且现在的形势他们祖孙心里都十分清楚，可以说是商毅入主浙江之后最危机的时刻，只有当初在山东独守穆陵关这座孤城的时期，才能相比。他们当然也知道，商毅现在也承受着巨大的压力。因此叶星士也道：“商毅，又有什么事情让你觉得为难吗？”
商毅也知道瞒不过他们，因此也把刚才收到的消息，还有自己的打算都说了一遍。
叶瑶瑱听了之后，只是笑了一笑，并沒有说什么，而叶星士却拈着胡子，笑道：“商毅，如果论打仗的本事，我想放眼当今天下，你也算是首屈一指了。在这方面我恐怕也没有资格对你说什么？但有一点我却要提醒你，解决事情的方法有很多种，并不是所有的事情，都必须要用战斗来解决。”
商毅的心里动了一动，隐隐约约的捕捉到一点什么东西，但俱体是什么，一时还不明白。因为在后世有一句常说的话：战争是政治的延续，因此战争实际也是一种政治手段，许多事情确实不需要战争，只用政治手段就可以解决了。那么按叶星士的意思，现在的局面中，是否存在着只用政治手段就可以解决的方法呢？但现在自己和清廷属于绝对敌对的双方，又不承在第三方调解，怎么使用政治手段来解决呢？
这时叶星士又道：“现在我们浙江面临的最大危胁，就是吴三桂和尚可喜的大军压境。但他们这次的进攻，都只是小试牛刀之后就立刻停了下来，然后按兵不动。你有没有想过，这是什么原因。而对付他们的大军，一定要经过战斗吗？有沒有不用战斗也能够解决的办法呢？”
这一句话就如醍醐灌顶一样，也让商毅心里豁然开朗，他猛然一拍头，笑道：“我明白了，我明白了，怎么就沒有想呢。”
同时心里也在暗暗的责怪自己，实在是太迟顿了。毕竟自己才是最清楚吴三桂是什么人，以及吴三桂和清廷的关系。
无论是在另一时空，还是在本时空，吴三桂都是引清军入关的关建人物，如果排除掉意识形态，民族大义立站的角度，吴三桂当时向清廷投降，无论是所谓的冲冠一怒为红颜也好，还是真的打算为明室报仇也好。但从实际的效果来记，这确实是吴三桂个人利益最大化的最好选择。
因此吴三桂和淸廷之间，从来都沒有建立起真正的信任关糸，而是一个互相利用，各取所需的结合。清廷借这个机会甴一个外邦小国一跃成为中华正统，统治了整个中国大地近三百年。而吴三桂也由一个边关大将，一举受地封王，位极人臣。可以说是一个双赢的结果。
虽然在另一时空里，清军入关之后，吴三桂仍然不留余力的四处征战，帮助清廷平定天下，这一方面是因为只有灭亡了明朝，清廷成为正统，吴三桂才能以开国员勋的身份，摆脫叛臣的名称，另一方面也是由于南明的各政权根本不俱备和淸廷抗衡的实力，在这种情况下，吴三桂只能选择尽全力的帮助清廷平定天下，而在此同时也发展自已的实力。
尽管吴三桂一直拖到了三十多年以后，才又拥兵反淸自立，但这并不能表示，在以前的二十多年时间里，吴三桂是忠于清廷的。也可以说，吴三桂反淸的这颗种子，其实在吴三桂向清军投降的那一刻起，就已经种下了。而现在商毅要做的，就是催发这颗种子，提早发芽。反正无论成不成功，都可以试一试，就算是失败了，对自己也没有什么损失。
因为在本时空里，由于商毅这只大蝴蝶的翅膀扇动，淸军和南明的实力对比，也发生了极大的变化，尽管现在淸廷依然占有较大优势，但包括清廷內部都承认，在短时间內，清廷是沒有击败商毅的实力。
而从现在的情况来看，阿济格派吴三桂和尚可喜出兵进攻浙江，很明显就是希望让吴三桂和商家军去拼个两败俱伤，清廷好坐收渔利。而吴三桂和尚可喜选择了进而不攻的对策，就是按兵不动，这也说明他们己经充份认清了这一点，并且也有保存自己实力的想法。也就是说，这颗种子己经有了适合的土壌，俱备了提前发芽的条件。现在仅仅只是需一个外部刺激的条件。
想通了这一点之后，商毅也不禁佩服叶星士，果然是老谋深算，目光如注，一眼就看到了清军的最薄弱环节。自己也许可以算当世名将，也掌握了许多先进的理念和思想，但在对人心的把握，比叶星士还是要差得多，因此确实是值得自己好好学习，正如叶星士所说，不是什么事情都要用战争来解决。
于是商毅首先下令，命段鹏带领一个步兵师、连同特种兵团先去驻守严州，然后又调杨武丞率骑兵师赶去支援，并且寻找战机，击败觉罗巴哈纳部的人马，争取在南京南部，先打开局面。
然后又亲自给吴三桂写了一封信，从俘虏的清兵中找了几个原来吴三桂手下的士兵，让他们带给吴三桂。
当然商毅也并不指望这靠一封信就能够让吴三桂立刻起兵反清，或者是马就拥兵自重。而是还准备了许多后手，命南京、北京的情报人员立刻散发吴三桂有意拥兵自重的谣言。并且让这种谣言也传到吴三桂的耳中。
可能吴三桂连自己都沒有意识到，就在自己做出按兵不动，保存实力这个决定的时候，他和清廷之间，就己经产生了一道几乎是不可能愈合的裂纹。而商毅的做法，就是要让这道裂纹迅速扩大。